De onderwijsinstellingen hadden de ambitie om een duurzame school te betreden. Om die reden is het gebouw energieneutraal geworden. De warmte en koude wordt opgewerkt door middel van een bodemenergiesysteem (WKO). In de school wordt de koude en warmte afgegeven door middel van vloerverwarming. Via de lucht kan de temperatuur in de ruimten worden nageregeld.
De benodigde elektrische energie wordt opgewekt middels PV-panelen die op het dak van de school zijn gelegd. Centraal op het dak is een verdiept deel opgenomen, waarin de luchtbehandelingskasten zijn gerealiseerd. Dit zijn de longen van het gebouw, zij zorgen voor voldoende frisse lucht.
Er is gebruik gemaakt van warmteterugwinning door middel van een warmtewiel. Daarmee wordt de verse buitenlucht voorverwarmd met de afgevoerde lucht. De Fliert voldoet op bijna alle punten aan de uitgangspunten Frisse Scholenklasse A. De school heeft een energielabel A++++ en heeft een EPG berekening van -0,15 negatief.